10x Genomics公司已经测试完毕的组织类型有 人：心脏、肾脏、卵巢、淋巴结、大脑、大肠、肺、脾脏、肝癌、乳腺癌、鼻黏膜（息肉）、甲状腺癌、前列腺癌、胆囊癌、食管癌、囊胚、喉癌、胶质瘤 小鼠：大脑、眼睛、心脏、肾脏、大肠、肝脏、肺、卵巢、四头肌、小肠、脾脏、胃、睾丸、甲状腺、舌头 大鼠：大脑、肾脏、心脏
FF样本：正常的胰腺（人/小鼠都不建议）、骨头、软骨、椎间盘、脂肪组织，血管； FFPE样本（人/小鼠）：骨（切片困难）、软骨、脂肪（可尝试上CytAssist仪器）、正常胰腺（可尝试上CytAssist仪器）
这类组织在冷冻包埋时难保持其原本的形态结构，很难调整到合适的位置以保证切片时切到感兴趣的截面。可以先拿组织多进行一些冷冻包埋和切片的预实验，提高正式样本的成功率，如果眼睛组织老师不关注晶状体的基因，建议摘除晶状体后进行包埋展开实验。
胰腺组织属于相比较困难的组织，可在以下环节注意：样本收集：将收取到的新鲜样本放到加入0.01%胰蛋白酶抑制剂的无钙镁的PBS中，新鲜的样本包埋要快，取样时注意剔除脂肪组织；按照标准进行样本收集和透化后，质检结果合格（RNA值＞6），透化未出现无荧光的现象，说明mRNA未被胰腺中的酶全部降解，可以进行后续实验。
不能，玻片是一次性耗材，实验流程中包含玻片染色、冲洗、重新干燥等多个步骤，这些步骤会破坏未使用的捕获区域上的寡核苷酸条形码，并降低其整体的灵敏度，同理，空间基因表达玻片有四个捕获区域，也只能使用一次。
如果组织先冰冻处理，组织内部会产生冰晶损伤组织形态，可能切片找不到满意的截面，还是建议各位老师取到组织后先包埋再冰冻。
一张好的HE染色切片染色后细胞质呈粉红色，细胞核呈蓝紫色，结缔组织呈粉红色，肌肉呈深红色，血管呈粉红色，细胞着色清晰，颜色艳丽，细胞形态清晰，界线清楚。冰冻切片与石蜡切片的实验目的不同，使用的染色液和染色方法也不同，冰冻切片需要尽可能保证RNA的完整，所以在染色过程中不会使用分色液、二甲苯、乙醇等，而石蜡样本则无需考虑这一点。
空间转录组项目仅收集组织样本的少量切片进行RNA抽提质检，并非整块组织的总RNA，不同切片位置对应的组织在RNA完整性上可能存在差异，尤其是切片的组织部位有坏死或大部分为结缔组织，可能会影响抽提结果。
不建议1个包埋盒放多个组织样本，最好将每个组织块单独包埋，防止多个组织在1个OCT包埋块中同时切片，无法满足所有样本预期的目标区域，如果老师对目标截面要求不高，一起包埋的单个组织截面大小不超过2.5mmx2.5mm，因为10x捕获框的大小为6.5mmx6.6mm，需要确保一起包埋组织的大小不超过捕获框的大小才能有效捕获组织切片的信息。
切面取决于客户的研究目的，切片需要涵盖研究关注的区域，特别是像脑组织等具有复杂结构的组织或有特殊要求的。建议客户到公司共同完成切片的过程，提高切片的成功率，也减少中间沟通的时间成本；像肿瘤组织，最好能包含癌、癌旁和癌远端组织，一般在可以选择的范围内选择最大截面进行切片。
