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Chem Rev封面文章 | 北京林业大学王晓东/付玉杰教授领衔!一文搞懂空间多组学神器MALDI基质的来龙去脉!

2026-04-13
中科新生命
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自1985年诞生至今,基质辅助激光解吸/电离质谱(MALDI-MS)已走过40年历程。从最初突破生物大分子检测的瓶颈,到如今成为蛋白质组学、代谢组学乃至空间多组学的核心工具,这项技术背后凝聚了13位诺贝尔奖得主的智慧与贡献。而贯穿其发展的一条主线——基质,这个看似辅助、实则决定实验成败的关键角色。

图1  MALDI-MS质量分析器

 

 

MALDI基质在MALDI-MS和MALDI-MSI分析中起着至关重要的作用。选择和应用合适基质能够实现特定化合物的高效检测。近期,北京林业大学生物科学与技术学院王晓东教授团队、付玉杰教授团队受邀在化学领域旗舰期刊 Chemical Reviews 上发表题为“MALDI Matrix: Origins, Innovations, and Frontiers”的教科书式长篇综述文章(全文共计205页),并成功入选该期刊封面论文,系统梳理了自1985年至今MALDI基质研究的发展全貌。

 

在本文中,作者首先介绍MALDI-MS的基本原理和实验步骤,然后考察了基质研究的最新进展,包括传统和新型基质的开发和应用,主要基质类型如下:

1.有机基质;

2.无机材料的无机基质;

3.有机-无机混合基质。

 

新型基质在 MALDI-MS 中的迅速发展和应用,能满足各种分析需求,其显著特性包括增强分析物电离效率和灵敏度、增加分子量以减少基质离子干扰、减少小分子的挥发性及通过 MALDI-MS 提高分析化合物结构的能力。合适的基质使MALDI-MS可检测质量范围已从大分子的高分子量区域扩展到了低分子量区域,涵盖了蛋白质、肽、脂质和碳水化合物等。

图2  467种MALDI基质详细分类

 

MALDI-MS 和 MALDI-MSI 因其高通量和原位分析能力展现出显著的空间多组学应用潜力。通过 MALDI-MSI 技术获得空间多组学数据与其他转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据相结合,为系统生物学提供新视角,有望为复杂疾病(包括但不限于癌症、神经退行性疾病和自身免疫性疾病)中组织特异性分子提供深刻见解,还将加速在空间分辨率上发现有临床转化价值的生物标志物,从而促进精准诊断、个性化治疗和监测治疗效果。此外,还可以开启新的研究领域,例如阐明胚胎发育、组织再生和维持组织稳态的分子水平的空间调控机制。

图3  MALDI-MS的组件及数据分析

 

 

实用tips

万字长文回顾了 MALDI 40多载的发展历程中,对深度空间代谢组项目实际执行中的标准化建议如下:

1. MALDI 的灵敏度受到电离程度的限制,从而限制了离子化效率。为提高灵敏度,Soltwisch等人引入了 MALDI-2后离子化激光策略,以在气相中启动一种类似于MALDI 的二次离子化过程,调整激光束并在MALDI离子源内部安装聚焦透镜,主光束有效直径达到5μm,显著提高了脂质、脂溶性维生素和碳水化合物的离子产率,使其提升两个数量级,实现动物和植物组织实现5 μm高分辨率成像。

图4  MALDI-2后电离技术

图5  MALDI-2灵敏度提升1-3数量级

中科新生命布局的深度空间代谢组是Bruker灵敏度最高的timsTOF fleX MALDI-2,已对多种组织实现5μm、10μm等高分辨率的空间成像。

 

2. 在样本准备环节,新鲜的、未经过修饰的组织样本做包埋处理,保持组织空间形态、尽可能避免代谢物变化,样本切片后将目标切片置于MALDI专用的导电(ITO涂层)玻璃载片上。

中科新生命可提供MALDI2专用导电玻片和组织包埋指导视频,联系销售即可获得。

 

3. 使用基质的意义:合适的基质不仅可以提高分析物的电离效率,提高灵敏度、耐盐性和整体适用性,并且在感兴趣的质量范围内避免产生干扰离子,是特定化合物检测的关键。

中科新生命已有成熟基质解决方案,根据老师的研究方向选择最佳基质。

 

4.配置专业的TM Sprayer(HTX)等自动化基质喷涂仪则具有高效性、自动化和便利性,与手动方法相比,能大大减少操作时间并提高沉积均匀性,从而提高了检测效率。

中科新生命配备专业的TM Sprayer(HTX)自动化基质喷涂仪👍

图6  TM-Sprayer

 

 

总结

基于上述技术优势,中科新生命深度空间代谢组服务已助力多位用户在肿瘤、疾病机制研究、植物学等领域发表高水平研究论文。通过整合MALDI 2高灵敏度平台、标准化样本制备、优化基质选择和自动化喷涂流程,我们正在推动空间代谢组学从“看得到”走向“看得准、看得细”

展望未来,随着基质研究从经验探索迈向机理驱动与AI辅助设计,MALDI-MS有望在定量准确性、空间分辨率和多组学整合能力上实现全新突破。届时,空间蛋白质组学、空间代谢组学、空间脂质组学和空间糖组学将真正融合,为系统生物学和精准医学提供前所未有的分子视野。

 

 

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关于中科新生命

 

 

上海中科新生命生物科技有限公司(APTBIO)创立于 2004 年,由原中国科学院上海生命科学研究院蛋白质组研究中心孵化而来,是国内质谱多组学应用领域的开拓者。公司以 “AI + 质谱多组学” 双核驱动创新,构建智能化组学生态。拥有自主知识产权的质谱检测平台与 AI 大数据分析系统,聚焦科技服务、生物医药及大健康消费三大领域,为全球科研机构、医院、药企提供从基础研究到临床转化的一站式解决方案。融合多组学技术与人工智能,围绕生物标志物发掘、药物靶点筛选及个性化诊疗等方向,构建具有国际竞争力的组学数据库与算法模型,推动转化医学进程,加速创新药物研发,成为推动生命科学数字化升级的核心引领者。