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祝贺!我司助力客户斩获Molecular Plant顶刊!山东农大庄焜扬团队揭秘番茄低温光合损伤调控机制!

2026-07-31
中科新生命
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低温胁迫(0–12℃)是制约全球作物生长和产量的重要环境因素。在番茄等喜温作物中,低温会严重损伤光合作用系统——从类囊体电子传递、碳同化循环到气孔导度调控均受抑制。当卡尔文-本森-巴萨姆(CBB)循环活性下降时,光驱动电子传递链产生的过剩电子会产生活性氧(ROS),引发光系统II和I的慢性光抑制。尽管植物已进化出多种转录因子介导的防御机制,但光合作用在低温下受损的分子机理及保护策略仍存在大量空白。

2026年7月7日,山东农业大学庄焜扬团队在国际植物科学顶刊Molecular Plant(IF 32.7)发表重磅研究论文“The SlbZIP30-SlbZIP51 module safeguards photosynthesis under chilling stress by coordinating nuclear transcriptional activation and chloroplast protein stabilization in tomato”。研究团队在番茄中鉴定出一个由双定位转录因子SlbZIP30和核质穿梭因子SlbZIP51构成的双重空间光保护模块:SlbZIP30在叶绿体中通过与SlLHCA1和SlTPI1互作稳定光合蛋白,同时在细胞核中与SlbZIP51形成异源二聚体激活 SlCPN60a1、SlTPI2 和 SlRBCS1 的转录。这一跨越叶绿体与细胞核的双重调控机制,为培育耐低温作物提供了全新的分子靶点和工程化策略。中科新生命有幸为该研究提供蛋白质组学检测与数据分析服务。

 

 

 

研究材料

番茄野生型及各类转基因材料

 

 

研究技术

TMT标记定量蛋白组、IP-MS/MS、转录组学(RNA-seq)、酵母双杂交(Y2H)、双分子荧光互补(BiFC)、荧光素酶互补成像(LCI)、Co-IP、EMSA凝胶迁移、ChIP-seq/ChIP-qPCR等。

 

 

实验结果

1.SlbZIP30双定位特性决定其双重光保护功能

SlbZIP30是番茄bZIP家族中唯一具有叶绿体转运肽(CTP,1–41位氨基酸)的成员。亚细胞定位显示,SlbZIP30-GFP同时定位于叶绿体和细胞核;叶绿体定位依赖N端CTP,核定位依赖Ser124位点磷酸化(S124A突变后核定位丧失)。低温下,SlbZIP30转录和蛋白水平均上升,且呈现动态分布:早期积累于细胞核,后期转向叶绿体。

功能验证表明,slbzip30 突变体在4℃处理12 h后严重萎蔫,相对电导率和ROS升高;过表达株系耐低温性增强。核定位缺失(S124A)或叶绿体定位缺失(ΔCTP)突变体仅能部分回补表型,证明双重定位缺一不可。光合参数显示,突变体净光合速率、PSII和PSI量子产量降至最低,而过表达株系维持最高;CO₂响应曲线证实SlbZIP30通过维持Rubisco和磷酸丙糖异构酶(TPI)活性保障碳同化。免疫印迹表明,过表达株系中Rubisco大亚基(RBCL)和小亚基(RBCS)积累量显著高于野生型,突变体中大幅下降。

图1 SlbZIP30保护低温胁迫下的光合作用

 

 

2.SlbZIP30通过蛋白互作稳定叶绿体光合蛋白

为解析机制,团队开展IP-MS/MS(中科新生命提供)与Y2H文库筛选联合分析,鉴定出4个重叠互作蛋白,包括SlTPI1和SlLHCA1。LCI和BiFC证实SlbZIP30与二者在叶绿体中直接互作,去除CTP后互作消失。

SlLHCA1是PSI外围天线蛋白,SlTPI1是CBB循环核心酶。低温下,突变体中SlLHCA1和SlTPI1蛋白水平显著下降,PSI活性和TPI活性严重受损。蛋白质组学进一步显示,过表达株系中碳代谢、碳固定和光合通路蛋白(RBCL、RBCS、TPI、CPN60α1及PSAF、PSAE、LHCA1等)显著上调,突变体中则下调。以上揭示叶绿体定位的SlbZIP30通过直接互作稳定光合蛋白,保护光合机构免受低温降解。

图2 SlbZIP30互作蛋白的筛选与验证

 

 

3.SlbZIP30-SlbZIP51异源二聚体低温激活碳同化关键基因转录

转录组显示碳固定相关基因(RBCS3B、RBCS1、GAPA、GAPB、TPI2、CPN60α1)和光系统相关基因在过表达株系中上调,在突变体中下调。但Y1H表明SlbZIP30不能直接结合这些启动子,提示需共调控因子。

IP-MS/MS和Y2H共同鉴定出SlbZIP51为核内关键互作伙伴。BiFC显示25℃时二者在细胞质互作,4℃转至细胞核;Co-IP证实Ser124对低温核互作至关重要。slbzip51 单突变和双突变体在低温下碳同化严重缺陷,Rubisco含量/活性和TPI活性显著降低。ChIP-seq鉴定SlbZIP51全基因组结合位点,KEGG富集显示碳代谢通路显著;de novo基序鉴定出VRE核心基序(AGCTGT/G)。ChIP-seq信号表明SlbZIP51在4℃下特异性结合 SlRBCS1、SlTPI2 和 SlCPN60a1 启动子,25℃无信号。Y1H、EMSA和ChIP-qPCR验证了直接结合。双荧光素酶实验显示,单独SlbZIP51激活三个靶基因启动子;共表达SlbZIP30增强激活;而S124A突变体仅产生与SlbZIP51单独相当活性。说明低温诱导SlbZIP51核转位后与SlbZIP30形成异源二聚体,协同激活靶基因转录。

图3 SlbZIP51在维持Rubisco水平中的关键作用

 

 

 

4.SlbZIP51低温核转位可工程化为冷响应开关模块

SlbZIP51-GFP在25℃定位于细胞质,低温处理30 min内转入细胞核,恢复常温后核信号消失,呈现可逆穿梭。

团队据此设计冷响应模块(CRM):将转录失活突变体SlbZIP51^(K187R)与GAL4-DNA结合域和VP16激活域融合,置于35S启动子;靶基因 ANT1(调控花青素合成)置于含GAL4元件的合成启动子驱动。低温诱导融合蛋白入核激活 ANT1,促进花青素积累;恢复常温后返回细胞质,激活终止。CRM转基因番茄在低温下花青素显著升高,Fv/Fm更高,ROS更低;RT-qPCR显示 ANT1 在低温处理1–3 h上升,恢复1 h回落。这证明了基于内源调控元件构建可编程、可逆温敏遗传回路的可行性。

图4 SlbZIP51通过VRE基序直接结合靶基因启动子并激活转录

 

 

5.SlDREB26是SlbZIP30低温诱导表达的上游正调控因子

SlbZIP30启动子含CACCGCC基序(DREB家族结合位点)。Y1H筛选出SlDREB26特异性结合该基序,EMSA和ChIP-qPCR验证特异性,双荧光素酶证实SlDREB26激活SlbZIP30启动子。SlDREB26本身受低温诱导,其RNAi株系低温下萎蔫加重,REC升高、Fv/Fm降低,RBCL/RBCS含量下降,同时SlbZIP30转录降低。这些结果确立了 “低温→SlDREB26→SlbZIP30” 的上游调控层级。

图5 SlDREB26作为SlbZIP30上游正调控因子的鉴定与功能验证

 

 

核心亮点

 

 

 

 

 

 

 

 

① 首次揭示bZIP转录因子“双定位-双功能”光保护新模式:SlbZIP30是番茄bZIP家族唯一同时定位于叶绿体和细胞核的成员。叶绿体中互作稳定SlLHCA1和SlTPI1;细胞核中与SlbZIP51异源二聚体激活靶基因转录,双重协同保障低温下光合机构结构和功能。

 

② 发现SlbZIP51低温依赖性核质穿梭机制及其转录调控功能:SlbZIP51常温驻留细胞质,低温30 min快速入核,恢复后返回。通过识别VRE基序(AGCTGT/G)直接结合 SlRBCS1、SlTPI2、SlCPN60a1 启动子,这三者分别编码Rubisco小亚基、CBB循环核心酶TPI和Rubisco折叠伴侣CPN60α1,共同构成碳同化核心保障。

 

③ 建立基于内源调控元件的可编程冷响应遗传回路:利用SlbZIP51核转位特性,工程化构建冷响应模块(CRM),实现目标基因 ANT1 低温可逆诱导表达,驱动花青素积累、增强ROS清除、保护光系统,为智能抗逆育种提供“即插即用”合成生物学工具。

 

④ 多层次组学技术联用系统解析光保护调控网络:整合蛋白质组学、转录组学、ChIP-seq、IP-MS/MS、Y2H文库筛选、Y1H、EMSA、BiFC、LCI及Co-IP等技术,从蛋白互作、转录调控、顺式元件到全基因组结合图谱,构建了从上游SlDREB26→双定位SlbZIP30→核共调控SlbZIP51→下游靶基因SlRBCS1/SlTPI2/SlCPN60a1及叶绿体靶蛋白SlLHCA1/SlTPI1的完整通路。

全文核心调控通路模型总图

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

小结

该研究通过蛋白质组学(中科新生命提供)、转录组学、ChIP-seq、IP-MS/MS及Y2H筛选等多组学联用,系统解析了番茄SlbZIP30-SlbZIP51模块的双重光保护机制。叶绿体中SlbZIP30稳定SlLHCA1和SlTPI1,保护光系统和CBB核心酶;细胞核中低温诱导SlbZIP51核转位,与SlbZIP30异源二聚体协同激活 SlCPN60a1(保障Rubisco大亚基折叠)、SlRBCS1(提供小亚基)和 SlTPI2(TPI补偿)的转录。上游由低温诱导的SlDREB26启动。基于SlbZIP51可逆核转位开发的冷响应模块(CRM),实现了目标基因低温可编程、可逆表达调控。

该研究不仅揭示了植物协同叶绿体蛋白稳定与核转录激活应对低温的新机制,更为作物耐低温智能育种提供了全新分子靶点和合成生物学工具。

 

 

 

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