Mol Plant项目文章 | 如何预测修饰位点？河南农业大学团队开发 PlantPTM，解锁植物修饰研究“预言家”
2026-09-21
中科新生命多组学服务
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翻译后修饰（PTM）可协调蛋白质功能以维持代谢稳态，可促进植物对动态环境的适应并调控多种细胞过程。因此，识别PTM对阐明植物生长、发育和应激反应的机制至关重要。
如何在研究前期高性价比预测植物中可靠的修饰位点？2026年8月，我司合作客户河南农业大学陈震副教授、豆根生副教授、李俊周教授研究团队在《Molecular Plant》（IF32.7）上发表题为“PlantPTM: A deep learning framework integrating protein language models with multi-view features for predicting diverse post-translational modification sites in plants”的研究性论文。该研究构建了植物特异、支持9种翻译后修饰类型（N-糖基化、S-酰化、2-羟基异丁酰化、巴豆酰化、琥珀酰化、丙二酰化、乙酰化、泛素化、磷酸化）和6种植物（拟南芥、水稻、玉米、小麦、大豆、番茄）的深度学习预测框架，以实现翻译后修饰类型的高精度预测，为大规模植物功能蛋白质组学研究与作物分子育种提供修饰类型预测平台（PlantPTM）。中科新生命为该研究提供了乙酰化和泛素化修饰蛋白质组检测服务。
该研究为蛋白质组范围的PTM发现和优先级排序提供有效的互补策略，有助于在植物中实现可扩展且系统化的PTM表征。
中科新生命【奥斯卡DIA泛酰化-植物版】可一次性实现对样本中的乙酰化、琥珀酰化、巴豆酰化的深度检测。在降低实验误差提升技术平行性的同时，可深度了解不同酰化修饰在样本中的差异表达。在数据挖掘时，不仅可聚焦某一类修饰角度深度挖掘，还可开展三种酰化之间的crosstalk分析。满足一次检测，三种修饰、四套结果、无限研究可能的科研需求。
关于中科新生命
上海中科新生命生物科技有限公司（APTBIO）创立于 2004 年，由原中国科学院上海生命科学研究院蛋白质组研究中心孵化而来，是国内质谱多组学应用领域的开拓者。公司以 “AI + 质谱多组学” 双核驱动创新，构建智能化组学生态。拥有自主知识产权的质谱检测平台与 AI 大数据分析系统，聚焦科技服务、生物医药及大健康消费三大领域，为全球科研机构、医院、药企提供从基础研究到临床转化的一站式解决方案。融合多组学技术与人工智能，围绕生物标志物发掘、药物靶点筛选及个性化诊疗等方向，构建具有国际竞争力的组学数据库与算法模型，推动转化医学进程，加速创新药物研发，成为推动生命科学数字化升级的核心引领者。
